Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rdh16f1E9Q9P8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rdh16f1E9Q9P8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms