Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DspE9Q557 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms