Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20518E9Q548 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms