Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trip11E9Q512 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trip11E9Q512 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trip11E9Q512 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms