Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71lE9Q4T4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc71lE9Q4T4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms