Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Susd1E9Q3H4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd1E9Q3H4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms