Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tarbp1E9Q368 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tarbp1E9Q368 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms