Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3250E9Q1M3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3250E9Q1M3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3250E9Q1M3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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