Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Fndc1E9Q043 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Fndc1E9Q043 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Fndc1E9Q043 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Fndc1E9Q043 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms