Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Chd2E9PZM4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Chd2E9PZM4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chd2E9PZM4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chd2E9PZM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms