Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gcom1E9PZ54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gcom1E9PZ54 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gcom1E9PZ54 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms