Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptbn4E9PX29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sptbn4E9PX29 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sptbn4E9PX29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms