Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cngb1E1AZ71 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cngb1E1AZ71 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cngb1E1AZ71 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cngb1E1AZ71 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms