Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1110002E22RikE0CYV9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1110002E22RikE0CYV9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1110002E22RikE0CYV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms