Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cldn24D3YXJ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cldn24D3YXJ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cldn24D3YXJ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms