Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cttnbp2B9EJA2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cttnbp2B9EJA2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cttnbp2B9EJA2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cttnbp2B9EJA2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms