Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mterf1bB9EJ57 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mterf1bB9EJ57 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mterf1bB9EJ57 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms