Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppfia4B8QI36 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ppfia4B8QI36 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppfia4B8QI36 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms