Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Phf11bB4XVQ1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Phf11bB4XVQ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Phf11bB4XVQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms