Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf11cB4XVP9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Phf11cB4XVP9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms