Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pnldc1B2RXZ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pnldc1B2RXZ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms