Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Siah3B2RWG3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Siah3B2RWG3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms