Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usf3B2RUQ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usf3B2RUQ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms