Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spocd1B1ASB6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spocd1B1ASB6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms