Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Prr29B1ARI9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prr29B1ARI9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prr29B1ARI9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms