Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Skint7A7XV04 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Skint7A7XV04 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms