Protein–RNA interactions for Protein: A6H584

Col6a5, Collagen alpha-5(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a5A6H584 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a5A6H584 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a5A6H584 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms