Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp8b5A3FIN4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp8b5A3FIN4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp8b5A3FIN4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms