Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CatsperbA2RTF1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CatsperbA2RTF1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms