Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl41A2AUC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl41A2AUC9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl41A2AUC9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms