Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Upf2A2AT37 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Upf2A2AT37 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Upf2A2AT37 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Upf2A2AT37 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms