Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn3aA2ASI5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn3aA2ASI5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn3aA2ASI5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms