Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scn1aA2APX8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scn1aA2APX8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scn1aA2APX8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scn1aA2APX8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms