Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc4a11A2AJN7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc4a11A2AJN7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc4a11A2AJN7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms