Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sec16aA2AIX1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sec16aA2AIX1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms