Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brwd3A2AHJ4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brwd3A2AHJ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Brwd3A2AHJ4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brwd3A2AHJ4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms