Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl2A2AFH2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2dnl2A2AFH2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2dnl2A2AFH2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms