Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C87977A2A958 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87977A2A958 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87977A2A958 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C87977A2A958 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C87977A2A958 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C87977A2A958 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C87977A2A958 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C87977A2A958 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms