Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramef6A2A8M8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramef6A2A8M8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef6A2A8M8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms