Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sppl2cA2A6C4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sppl2cA2A6C4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms