Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Krtap1-3A2A588 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Krtap1-3A2A588 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms