Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgap3A2A559 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgap3A2A559 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms