Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam71e1A1L3C1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms