Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
A0A0U1RNP2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RNP2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms