Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg4a-psA0A0G2JFS9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms