Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28171A0A087WQ19 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28171A0A087WQ19 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm28171A0A087WQ19 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm28171A0A087WQ19 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm28171A0A087WQ19 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm28171A0A087WQ19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm28171A0A087WQ19 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms