Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms