Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms