Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chrac1Q9JKP8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms