Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pole3Q9JKP7 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Pole3Q9JKP7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Pole3Q9JKP7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Pole3Q9JKP7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Pole3Q9JKP7 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Pole3Q9JKP7 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms